内部今、古文两派的长期对峙，造成了派系错综林立的状况，以致互相攻讦，势不两立。无论从政治角度，还是从学术角度而言，统一经学都是一种必然趋势。
郑玄是古文经学集大成者。郑玄遍注古文经，但他并不墨守成规，能够择善而从，兼采今文经学的某些说法，形成了自己的学派，号为“郑学”，成为魏晋以后经学的主流。郑学兴起以后，今文经学已退居次要地位，古文经占了上风。
自郑玄所注诸经行世，此前各守门户的今文经和古文经，不再为人们所遵信，并逐渐被摒弃、淘汰。于是，郑注古文费氏《易》流行，而今文的施、孟、梁丘、京氏四家《易》遂废止；郑注《古文尚书》流行，而今文的大夏侯、小夏侯和欧阳三家《尚书》便散失；郑笺《毛诗故训传》流行，今文的齐、鲁、韩三家《诗》即不显；郑注《三礼》流行，大、小戴和庆氏《礼》遂不行；郑注《论语》流行，鲁、古《论语》终散佚。一时之间，郑玄的经说压倒了其他各家经说。由于经生皆从郑氏，经学几乎成了郑玄的一统天下，“郑学”也几乎成了经学的代名词，正所谓“经学至郑君一变”。
早期儒学讲仁义，比理学的忠孝要合理、人道一些。但是儒学的逻辑有问题。在白马会议上，对于汤武的争论说明儒学存在内部的寥误。所以早期的儒学其实是一个中庸的、模糊的实践处世方式，子有许多地方不语，并非严密的哲学。但其理论并不可行，皇帝只是利用之，外儒内法，或者外儒内黄（老）。王莽的失败标志着早期儒学的破产。
中国封建历史从战国时代到后来的秦并吞天下合一，儒家思想和道家思想为正统治国思想，虽然到了后来的西汉，汉武帝刘彻以董仲舒为首的提倡：“罢黜百家，独遵儒术”思想，一直到了后来的中华民国，*的批林批孔，直至现在，我们都有流淌着儒家思想的，可见儒家思想对中国影响之大，之深远。但是，话说回来，中国古代封建历朝历代，大都是“外儒内黄”，也就是说是以“黄道”（黄是道家的鼻祖人物）来治国治民的！可见道家思想的重要性，其生命力绝对不逊色于儒家思想！
东汉末年古文经学的代表人物如马日磾、蔡邕、许相许劭许靖、卢植等人都研习黄老，他们博采两家之长，认为强国之路还是外儒内黄为好，而不是独尊儒学。
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刘邦带军攻入秦国时，诸将都去抢金银财宝，而萧何则带人去抢秦朝的档案馆，这样萧何就掌握了秦朝的人口、地理、法律等资料。建国后萧何根据秦国的法律
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