新世纪福音，曾经与“末日真理”和“死海使徒”构成末日真理教的三巨头之一，在三巨头分道扬镳后沉默了很长很长的一段时间。在此期间，桑海沧田，“末日真理”改组为如今的“末日真理教”，而“死海使徒”则假托“纳粹”之名义，于第二次世界大战后迁移到了月球，最终与“纳粹”不分彼此。只有新世纪福音的动向无人知晓，在女巫VV再一次踏上舞台前，没有人知道这个巨头是如何维持自身机构，又是如何运作这个结构的——它们下潜得太深太深，但其成员却完美地潜伏到了其他的组织中。
在女巫VV召唤成员之前，没有人知道这些成员，而当这些成员应召而来，这才察觉到，这些新世纪福音的成员竟然都是自己认知的身边之人。
新世纪福音在世人们展现出来的神秘又暧昧的模样，很大程度上与这个神秘组织的首领女巫VV对待末日真理的态度密切相关——谁能够想到呢？在过去，一次偶然的聚会中，身为过去末日真理教的发起者之一，当时还不曾叫做“女巫VV”的神秘女性，竟然根本不是末日真理的信徒。
即便是如今，女巫VV并不信仰末日真理，也并不追寻末日真理这一点，也鲜有人知。不过，无论知道的还是不知道的，大都已经死于战争中了，就连女巫VV本人也没有幸免。
事实上，新世纪福音重新登上战争舞台的时候，从来都没有人会想过，第一个出局的大型神秘组织竟然会是他们，第一个倒塌的末日真理教三巨头，竟然会是他们。
新世纪福音强不强？答案几乎不需要思考，当然很强大。女巫VV强不强？这也是同样的回答，仅仅从神秘性上，在人类中根本找不到能够与之并肩者，哪怕算上在战场上出现的怪物们，仅以个体而论，女巫VV也是站在最顶端的怪物之一——然而，就是这样的一个怪物，竟然突然间就出局了。
没什么人知道这其中到底发生了什么事情，没有几个人亲眼看到女巫VV被杀死的那一幕，只是，综合实力屈指可数的新世纪福音在某个时间段就已经销声匿迹了，就像是有一只无形的手，从战争的故事中，悄然擦去了他们的戏份一样。
到底是谁打败了女巫VV和她座下的强大信使们？又是用怎样的手段将综合实力强大的新世纪福音整个儿从战场上抹去？当幸存的神秘专家和神秘组织回过神来的时候，留给诸多人的，几乎都是一些难解的谜团——然而，并不是所有人都不知道这些秘密。
网络球里有人知道，桃乐丝知道，席森神父也知道。
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