若昂万没想到朱由检给他挖了个大大的坑，第一件事就是索要澳门的主权。但说出去的话又没法收回，既然同意了朱由检提出的“和平共处五项原则”，就不能不尊重大明对澳门的主权。
再想到葡萄牙与大明合作的广阔前景，若昂一咬牙一狠心，也只得与朱由检签署书面协议，上书：“如果葡萄牙王国恢复**，将承认大明帝国对澳门的主权，澳门现有葡人之居留权、经商权等问题容后再议。葡萄牙布拉干萨公爵若昂、大明帝国秦王朱由检。”
当然，这第一个条约的签署，也同时确立了另一件事，那就是中国对葡萄牙的称呼不再是“佛朗机”，而是按照葡萄牙语portuguesa的音译，正式改称“葡萄牙”。其实“佛朗机”本是阿拉伯人对欧洲的泛称，即对“法兰克”（frank）一词的转读。中国人不了解西方世界，以讹传讹，把所有欧洲人都称为“佛朗机人”，实乃大谬，朱由检当然要予以纠正。
第一个回合就被朱由检索回了澳门的主权，虽然只是字面上的东西，现在还无法落实，若昂还是感到落了下风。为了争取主动，他立即提出了欧洲人最常见、但也是屡屡被拒绝的要求：请求大明开放通商口岸。
孰料朱由检却一口答应，许诺只要确保葡萄牙商人遵守大明帝国的法律和规定，服从市舶司的监管，在不远的将来，中国将至少开放五处通商口岸，允许葡萄牙人自由出入贸易。
这一点在当时显然是离经叛道的，因为大明立国之后不久，即开始执行闭关锁国的政策，企图用隔绝中外往来的方式，减少外来文明对中华文明的冲击。这一锁就是几百年，直到鸦片战争，西方人用坚船利炮打开的中国的大门。事实证明，闭关锁国是极其愚蠢的鸵鸟政策，不但不能抵御外面的冲击，反而自废武功，让中国在妄自尊大中落后于世界。
所以朱由检早就下定决心要改变这种政策，转以开放的态度面对世界。五口通商只是开始，以后早晚还要实现全方位的开放。至于受到西方文明的冲击，朱由检并不害怕。因为文明的交流与融合是不可避免的，谁更先进，谁就能输出自己的文明。唐宋时期，中国实行的就是开放政策，可恰恰是在那段时期，中华文明在世界上确立了自己的巅峰地位。中华泱泱五千年文明，绝不会因为开放口岸自由通商而消失，这一点朱由检有着强大的信心。
若昂也没想到这么痛快地同意了自己的要求，在大喜的同时也有些懊悔，觉得朱由检关心的只是主权问题，自己还可以提出更高的价码
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