第二，成基命这个监军其实只是挂了个名，自己马上就可以用飞鸽传书通知李定国和李来亨，要他们全速开赴前线，不必理会什么“监军”。他们不用公然违抗命令，只需让成基命摸不着他们就行了。到时候只推说不知道有这么回事，看他怎么监！
第三，成基命可不是一般人，而是东林党的领袖人物之一。眼下廷推在即，成基命自然也是热门人选。如果让这样的人物进入内阁，天天质疑自己的决策，那还不得麻烦死。因此朱由检正好借着这个由头，把他打发出京去，他自然也就没法当阁臣了。
安排完西南平叛的事，朱由检又连下两旨，要皮岛副总兵黄龙和自己的岳父老泰山、登莱都指挥使戚显宗立即集结水师，出海搜寻后金水师的踪迹，发现之后予以歼灭。
对于朱由检的这个决定，大多数官员也并不赞成。一派认为来自海上的骚扰并非大患，与其大动干戈在海上搜寻敌人，还不如让皮岛驻军上岸攻击建虏的后方，戚家军也应调至山海关。
而另一派则恰恰相反，把后金水师想象得无比可怕，认为应该调福建的郑芝龙来助阵。
朱由检对这两种意见都置之不理。因为他很清楚，后金水师其实就是孔有德、尚可喜、耿仲明他们几个，也没有造船的能力，只要让明军逮着，必能一举消灭，所以根本没必要调郑芝龙。再者说，郑芝龙也未必奉诏，更何况他本身就是个大海匪。请神容易送神难，现在辽东方面已经够乱了，朱由检可不想郑芝龙再来搅局。
另一方面，皮岛和登莱水师，是朱由检未来打造海军的基础，他可舍不得让这支力量现在去和后金硬拼。现在他们只要能保护好向山海关运送粮食的航线就可以了，如果能顺便抵御倭寇的不时袭扰，就算超额完成任务了。
不过调郑芝龙这个建议，也给朱由检提了个醒，他蓦然想起，也许还有一支力量可以为己所用，那就是葡萄牙人！
早在陕西之时，他就与葡萄牙公爵若昂秘密达成协议，并且还派遣郑森等人赴澳门建立船厂、加入葡萄牙海军，暗中学习葡萄牙人的造船和航海技术。现在时间已经过去了将近半年，也不知道郑森他们在那边进展怎样了。如今自己已经是皇帝，也不用再藏着掖着了，和葡萄牙的合作完全可以公开化。
于是朱由检立即给仍在西安的汤若望、马尔蒂尼飞鸽传书，让他们马上联系澳门的葡萄牙人，看看能否派出一部分舰队北上。另外，他也希望和若昂以两国元首的身份，正式签订合作条约，在军事、
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